Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

(Back to Minerals by class)

271 alpha Resorcinol

(Previous)     (Back)     (Next)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     5.60   9.59  10.38  89.69  89.90  90.11    557.2   1.312
                                       PM6:     5.60   9.59  10.38  89.69  89.90  90.11    557.2   1.312

X-Ray Structure


Structure calculated using PM6


  X-Ray data set:
MERS=(2,1,1) 1SCF
 aRes

  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C             -3.53400000 +1    1.7880000 +1    0.8600000 +1                  0.0000
  C             -3.05200000 +1    0.7840000 +1    1.6670000 +1                  0.0000
  C             -1.84500000 +1    0.1740000 +1    1.3980000 +1                  0.0000
  C             -1.12400000 +1    0.5640000 +1    0.2820000 +1                  0.0000
  C             -1.59900000 +1    1.5730000 +1   -0.5450000 +1                  0.0000
  C             -2.80200000 +1    2.1980000 +1   -0.2480000 +1                  0.0000
  H             -4.08300000 +1    3.5560000 +1   -0.6170000 +1                  0.0000
  H              0.25400000 +1   -0.6970000 +1    0.6860000 +1                  0.0000
  H             -4.50100000 +1    2.2580000 +1    1.0770000 +1                  0.0000
  H             -3.63500000 +1    0.4520000 +1    2.5380000 +1                  0.0000
  H             -1.45900000 +1   -0.6200000 +1    2.0520000 +1                  0.0000
  H             -1.03600000 +1    1.8610000 +1   -1.4430000 +1                  0.0000
  O             -3.23400000 +1    3.1460000 +1   -0.9990000 +1                  0.0000
  C              6.42800000 +1   -2.3000000 +1    3.6600000 +1                  0.0000
  C              5.94600000 +1   -1.2960000 +1    4.4670000 +1                  0.0000
  C              4.73900000 +1   -0.6860000 +1    4.1980000 +1                  0.0000
  C              4.01800000 +1   -1.0760000 +1    3.0820000 +1                  0.0000
  C              4.49300000 +1   -2.0850000 +1    2.2550000 +1                  0.0000
  C              5.69600000 +1   -2.7100000 +1    2.5520000 +1                  0.0000
  H             -3.55299900 +1    5.4620000 +1   -3.4170000 +1                  0.0000
  H              2.64000000 +1    0.1850000 +1   -2.1140000 +1                  0.0000
  H              7.39500000 +1   -2.7700000 +1    3.8770000 +1                  0.0000
  H              6.52900000 +1   -0.9640000 +1    5.3380000 +1                  0.0000
  H              4.35299900 +1    0.1080000 +1    4.8520000 +1                  0.0000
  H              3.93000000 +1   -2.3730000 +1    1.3570000 +1                  0.0000
  O             -4.40199900 +1    5.8720000 +1    1.8010000 +1                  0.0000
  O              2.89400000 +1   -0.5120000 +1    2.8000000 +1                  0.0000
  C              1.73100000 +1    2.4650000 +1    0.8600000 +1                  0.0000
  C              2.21300000 +1    3.4690000 +1    1.6670000 +1                  0.0000
  C              3.42000000 +1    4.0790000 +1    1.3980000 +1                  0.0000
  C              4.14100000 +1    3.6890000 +1    0.2820000 +1                  0.0000
  C              3.66600000 +1    2.6800000 +1   -0.5450000 +1                  0.0000
  C              2.46300000 +1    2.0550000 +1   -0.2480000 +1                  0.0000
  H              1.18200000 +1    0.6970000 +1   -0.6170000 +1                  0.0000
  H             -5.01099900 +1    4.9500000 +1    0.6860000 +1                  0.0000
  H              0.76400000 +1    1.9950000 +1    1.0770000 +1                  0.0000
  H              1.63000000 +1    3.8010000 +1    2.5380000 +1                  0.0000
  H              3.80600000 +1    4.8730000 +1    2.0520000 +1                  0.0000
  H              4.22900000 +1    2.3920000 +1   -1.4430000 +1                  0.0000
  O              2.03100000 +1    1.1070000 +1   -0.9990000 +1                  0.0000
  O             -5.26499900 +1    4.2530000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              1.16300000 +1   -2.9770000 +1    3.6600000 +1                  0.0000
  C              0.68100000 +1   -3.9810000 +1    4.4670000 +1                  0.0000
  C             -0.52600000 +1   -4.5910000 +1    4.1980000 +1                  0.0000
  C             -1.24700000 +1   -4.2010000 +1    3.0820000 +1                  0.0000
  C             -0.77200000 +1   -3.1920000 +1    2.2550000 +1                  0.0000
  C              0.43100000 +1   -2.5670000 +1    2.5520000 +1                  0.0000
  H              1.71200000 +1   -1.2090000 +1    2.1830000 +1                  0.0000
  H             -2.62500000 +1    4.0680000 +1   -2.1140000 +1                  0.0000
  H              2.13000000 +1   -2.5070000 +1    3.8770000 +1                  0.0000
  H              1.26400000 +1   -4.3130000 +1    5.3380000 +1                  0.0000
  H             -0.91200000 +1   -5.3850000 +1    4.8520000 +1                  0.0000
  H             -1.33500000 +1   -2.9040000 +1    1.3570000 +1                  0.0000
  O              0.86300000 +1   -1.6190000 +1    1.8010000 +1                  0.0000
  O             -2.37100000 +1    4.7650000 +1   -2.8000000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -5.6000000 +1                  0.0000
  C             -3.53400000 +1    1.7880000 +1   -4.7400000 +1                  0.0000
  C             -3.05200000 +1    0.7840000 +1   -3.9330000 +1                  0.0000
  C             -1.84500000 +1    0.1740000 +1   -4.2020000 +1                  0.0000
  C             -1.12400000 +1    0.5640000 +1   -5.3180000 +1                  0.0000
  C             -1.59900000 +1    1.5730000 +1   -6.1450000 +1                  0.0000
  C             -2.80200000 +1    2.1980000 +1   -5.8480000 +1                  0.0000
  H             -4.08300000 +1    3.5560000 +1   -6.2170000 +1                  0.0000
  H              0.25400000 +1   -0.6970000 +1   -4.9140000 +1                  0.0000
  H             -4.50100000 +1    2.2580000 +1   -4.5230000 +1                  0.0000
  H             -3.63500000 +1    0.4520000 +1   -3.0620000 +1                  0.0000
  H             -1.45900000 +1   -0.6200000 +1   -3.5480000 +1                  0.0000
  H             -1.03600000 +1    1.8610000 +1   -7.0430000 +1                  0.0000
  O             -3.23400000 +1    3.1460000 +1   -6.5990000 +1                  0.0000
  C              6.42800000 +1   -2.3000000 +1   -1.9400000 +1                  0.0000
  C              5.94600000 +1   -1.2960000 +1   -1.1330000 +1                  0.0000
  C              4.73900000 +1   -0.6860000 +1   -1.4020000 +1                  0.0000
  C              4.01800000 +1   -1.0760000 +1   -2.5180000 +1                  0.0000
  C              4.49300000 +1   -2.0850000 +1   -3.3450000 +1                  0.0000
  C              5.69600000 +1   -2.7100000 +1   -3.0480000 +1                  0.0000
  H             -3.55299900 +1    5.4620000 +1   -9.0170000 +1                  0.0000
  H              2.64000000 +1    0.1850000 +1   -7.7140000 +1                  0.0000
  H              7.39500000 +1   -2.7700000 +1   -1.7230000 +1                  0.0000
  H              6.52900000 +1   -0.9640000 +1   -0.2620000 +1                  0.0000
  H              4.35299900 +1    0.1080000 +1   -0.7480000 +1                  0.0000
  H              3.93000000 +1   -2.3730000 +1   -4.2430000 +1                  0.0000
  O             -4.40199900 +1    5.8720000 +1   -3.7990000 +1                  0.0000
  O              2.89400000 +1   -0.5120000 +1   -2.8000000 +1                  0.0000
  C              1.73100000 +1    2.4650000 +1   -4.7400000 +1                  0.0000
  C              2.21300000 +1    3.4690000 +1   -3.9330000 +1                  0.0000
  C              3.42000000 +1    4.0790000 +1   -4.2020000 +1                  0.0000
  C              4.14100000 +1    3.6890000 +1   -5.3180000 +1                  0.0000
  C              3.66600000 +1    2.6800000 +1   -6.1450000 +1                  0.0000
  C              2.46300000 +1    2.0550000 +1   -5.8480000 +1                  0.0000
  H              1.18200000 +1    0.6970000 +1   -6.2170000 +1                  0.0000
  H             -5.01099900 +1    4.9500000 +1   -4.9140000 +1                  0.0000
  H              0.76400000 +1    1.9950000 +1   -4.5230000 +1                  0.0000
  H              1.63000000 +1    3.8010000 +1   -3.0620000 +1                  0.0000
  H              3.80600000 +1    4.8730000 +1   -3.5480000 +1                  0.0000
  H              4.22900000 +1    2.3920000 +1   -7.0430000 +1                  0.0000
  O              2.03100000 +1    1.1070000 +1   -6.5990000 +1                  0.0000
  O             -5.26499900 +1    4.2530000 +1   -5.6000000 +1                  0.0000
  C              1.16300000 +1   -2.9770000 +1   -1.9400000 +1                  0.0000
  C              0.68100000 +1   -3.9810000 +1   -1.1330000 +1                  0.0000
  C             -0.52600000 +1   -4.5910000 +1   -1.4020000 +1                  0.0000
  C             -1.24700000 +1   -4.2010000 +1   -2.5180000 +1                  0.0000
  C             -0.77200000 +1   -3.1920000 +1   -3.3450000 +1                  0.0000
  C              0.43100000 +1   -2.5670000 +1   -3.0480000 +1                  0.0000
  H              1.71200000 +1   -1.2090000 +1   -3.4170000 +1                  0.0000
  H             -2.62500000 +1    4.0680000 +1   -7.7140000 +1                  0.0000
  H              2.13000000 +1   -2.5070000 +1   -1.7230000 +1                  0.0000
  H              1.26400000 +1   -4.3130000 +1   -0.2620000 +1                  0.0000
  H             -0.91200000 +1   -5.3850000 +1   -0.7480000 +1                  0.0000
  H             -1.33500000 +1   -2.9040000 +1   -4.2430000 +1                  0.0000
  O              0.86300000 +1   -1.6190000 +1   -3.7990000 +1                  0.0000
  O             -2.37100000 +1    4.7650000 +1   -8.4000000 +1                  0.0000
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1  -11.2000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1    9.5300000 +1    0.0000000 +1 
 Tv             10.52999900 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
MERS=(2,1,1) GNORM=5
 aRes

  O        -0.30083004 +1   -0.3400071 +1   -0.1777346 +1                      0.0000
  C        -3.58693181 +1    1.9004577 +1    1.0341442 +1                      0.0000
  C        -3.10142425 +1    0.8926579 +1    1.8701394 +1                      0.0000
  C        -1.99748176 +1    0.1172073 +1    1.5005999 +1                      0.0000
  C        -1.38888194 +1    0.3747514 +1    0.2645095 +1                      0.0000
  C        -1.83187590 +1    1.3740541 +1   -0.6114170 +1                      0.0000
  C        -2.94175819 +1    2.1194295 +1   -0.1940546 +1                      0.0000
  H        -4.15237417 +1    3.6311516 +1   -0.7219621 +1                      0.0000
  H        -0.01437332 +1   -1.0683507 +1    0.4776053 +1                      0.0000
  H        -4.44872883 +1    2.4946337 +1    1.3248408 +1                      0.0000
  H        -3.59241928 +1    0.7058076 +1    2.8318677 +1                      0.0000
  H        -1.62603022 +1   -0.6658360 +1    2.1584604 +1                      0.0000
  H        -1.35157283 +1    1.5407479 +1   -1.5709259 +1                      0.0000
  O        -3.36930649 +1    3.0755418 +1   -1.0764802 +1                      0.0000
  C         6.42243291 +1   -2.4296518 +1    3.7698412 +1                      0.0000
  C         5.94204514 +1   -1.4314286 +1    4.6204717 +1                      0.0000
  C         4.83093642 +1   -0.6574189 +1    4.2703989 +1                      0.0000
  C         4.20558597 +1   -0.9100779 +1    3.0415361 +1                      0.0000
  C         4.64171232 +1   -1.9013756 +1    2.1531934 +1                      0.0000
  C         5.76309877 +1   -2.6414782 +1    2.5483226 +1                      0.0000
  H        -3.23480914 +1    5.5684859 +1   -3.5328658 +1                      0.0000
  H         2.82274794 +1    0.5152361 +1   -2.2939983 +1                      0.0000
  H         7.29050718 +1   -3.0218554 +1    4.0452137 +1                      0.0000
  H         6.44290104 +1   -1.2512634 +1    5.5783132 +1                      0.0000
  H         4.46608348 +1    0.1203293 +1    4.9383080 +1                      0.0000
  H         4.14827582 +1   -2.0665967 +1    1.2001976 +1                      0.0000
  O        -4.02410677 +1    6.1275269 +1    1.7084788 +1                      0.0000
  O         3.10677141 +1   -0.2005109 +1    2.6193487 +1                      0.0000
  C         1.63200894 +1    2.4417400 +1    1.0631383 +1                      0.0000
  C         2.15890722 +1    3.4345765 +1    1.8920426 +1                      0.0000
  C         3.28016559 +1    4.1771540 +1    1.5071976 +1                      0.0000
  C         3.86398177 +1    3.9022144 +1    0.2629124 +1                      0.0000
  C         3.38349044 +1    2.9114554 +1   -0.6027683 +1                      0.0000
  C         2.25636054 +1    2.2007748 +1   -0.1715278 +1                      0.0000
  H         0.99501814 +1    0.7254284 +1   -0.6825909 +1                      0.0000
  H        -5.10225894 +1    5.4356876 +1    0.4733745 +1                      0.0000
  H         0.75584726 +1    1.8750585 +1    1.3648477 +1                      0.0000
  H         1.68584197 +1    3.6366403 +1    2.8596505 +1                      0.0000
  H         3.68275289 +1    4.9491093 +1    2.1599719 +1                      0.0000
  H         3.84885409 +1    2.7257192 +1   -1.5660566 +1                      0.0000
  O         1.78869781 +1    1.2580298 +1   -1.0480447 +1                      0.0000
  O        -5.41822729 +1    4.7136452 +1   -0.1751058 +1                      0.0000
  C         1.18977381 +1   -3.0058200 +1    3.8183659 +1                      0.0000
  C         0.66307758 +1   -4.0009269 +1    4.6446063 +1                      0.0000
  C        -0.46406445 +1   -4.7357374 +1    4.2624749 +1                      0.0000
  C        -1.05315115 +1   -4.4513852 +1    3.0229623 +1                      0.0000
  C        -0.57018274 +1   -3.4614194 +1    2.1575329 +1                      0.0000
  C         0.56192268 +1   -2.7576834 +1    2.5871030 +1                      0.0000
  H         1.82128213 +1   -1.2792911 +1    2.0815120 +1                      0.0000
  H        -2.30762924 +1    3.7457104 +1   -2.3427276 +1                      0.0000
  H         2.06870371 +1   -2.4427842 +1    4.1195687 +1                      0.0000
  H         1.14073182 +1   -4.2102956 +1    5.6084410 +1                      0.0000
  H        -0.86828600 +1   -5.5088592 +1    4.9129799 +1                      0.0000
  H        -1.03815733 +1   -3.2709797 +1    1.1964525 +1                      0.0000
  O         1.03193987 +1   -1.8145649 +1    1.7114807 +1                      0.0000
  O        -1.98530786 +1    4.4617689 +1   -2.9946201 +1                      0.0000
  O        -0.29842826 +1   -0.3378882 +1   -5.7699519 +1                      0.0000
  C        -3.60040218 +1    1.8845767 +1   -4.5696535 +1                      0.0000
  C        -3.11720583 +1    0.8742209 +1   -3.7353299 +1                      0.0000
  C        -2.00965717 +1    0.1027261 +1   -4.1024378 +1                      0.0000
  C        -1.39230361 +1    0.3702340 +1   -5.3320050 +1                      0.0000
  C        -1.83237888 +1    1.3727906 +1   -6.2056689 +1                      0.0000
  C        -2.94892225 +1    2.1108613 +1   -5.7932444 +1                      0.0000
  H        -4.16150870 +1    3.6198410 +1   -6.3216383 +1                      0.0000
  H        -0.01078537 +1   -1.0655178 +1   -5.1142843 +1                      0.0000
  H        -4.46596333 +1    2.4746267 +1   -4.2814843 +1                      0.0000
  H        -3.61308481 +1    0.6812487 +1   -2.7774005 +1                      0.0000
  H        -1.64188884 +1   -0.6848634 +1   -3.4478689 +1                      0.0000
  H        -1.34482615 +1    1.5475596 +1   -7.1600352 +1                      0.0000
  O        -3.37766050 +1    3.0658792 +1   -6.6765051 +1                      0.0000
  C         6.42333436 +1   -2.4345262 +1   -1.8114676 +1                      0.0000
  C         5.94090563 +1   -1.4395418 +1   -0.9583421 +1                      0.0000
  C         4.82929334 +1   -0.6655386 +1   -1.3074711 +1                      0.0000
  C         4.20744379 +1   -0.9129395 +1   -2.5391874 +1                      0.0000
  C         4.64803746 +1   -1.8985801 +1   -3.4318907 +1                      0.0000
  C         5.76690115 +1   -2.6418589 +1   -3.0355934 +1                      0.0000
  H        -3.24812015 +1    5.5855826 +1   -9.1454537 +1                      0.0000
  H         2.81262752 +1    0.5360846 +1   -7.9119097 +1                      0.0000
  H         7.29094528 +1   -3.0277990 +1   -1.5364033 +1                      0.0000
  H         6.43969545 +1   -1.2624799 +1    0.0013048 +1                      0.0000
  H         4.46233975 +1    0.1088924 +1   -0.6368825 +1                      0.0000
  H         4.15974632 +1   -2.0568428 +1   -4.3886810 +1                      0.0000
  O        -4.01974208 +1    6.1281283 +1   -3.8760162 +1                      0.0000
  O         3.10894961 +1   -0.2027151 +1   -2.9606466 +1                      0.0000
  C         1.62405696 +1    2.4595349 +1   -4.5374875 +1                      0.0000
  C         2.14667178 +1    3.4592615 +1   -3.7140600 +1                      0.0000
  C         3.26876692 +1    4.2000058 +1   -4.0996462 +1                      0.0000
  C         3.86084438 +1    3.9122043 +1   -5.3370552 +1                      0.0000
  C         3.38463651 +1    2.9147166 +1   -6.1972307 +1                      0.0000
  C         2.25353949 +1    2.2092406 +1   -5.7675784 +1                      0.0000
  H         0.99239353 +1    0.7328783 +1   -6.2758597 +1                      0.0000
  H        -5.09614388 +1    5.4354438 +1   -5.1230071 +1                      0.0000
  H         0.74687578 +1    1.8949125 +1   -4.2349815 +1                      0.0000
  H         1.66946270 +1    3.6681058 +1   -2.7499538 +1                      0.0000
  H         3.66634139 +1    4.9798028 +1   -3.4531124 +1                      0.0000
  H         3.85614148 +1    2.7204082 +1   -7.1556943 +1                      0.0000
  O         1.78776504 +1    1.2630766 +1   -6.6410931 +1                      0.0000
  O        -5.41576853 +1    4.7164054 +1   -5.7727117 +1                      0.0000
  C         1.19404311 +1   -2.9991647 +1   -1.7735939 +1                      0.0000
  C         0.66604177 +1   -3.9928475 +1   -0.9463233 +1                      0.0000
  C        -0.45977166 +1   -4.7291982 +1   -1.3295022 +1                      0.0000
  C        -1.04736441 +1   -4.4476483 +1   -2.5704931 +1                      0.0000
  C        -0.56413268 +1   -3.4577119 +1   -3.4358173 +1                      0.0000
  C         0.56742467 +1   -2.7532001 +1   -3.0059625 +1                      0.0000
  H         1.82584493 +1   -1.2744295 +1   -3.5123190 +1                      0.0000
  H        -2.32316396 +1    3.7641456 +1   -7.9447190 +1                      0.0000
  H         2.07331597 +1   -2.4363555 +1   -1.4727412 +1                      0.0000
  H         1.14164817 +1   -4.2003158 +1    0.0190184 +1                      0.0000
  H        -0.86387055 +1   -5.5021468 +1   -0.6787562 +1                      0.0000
  H        -1.03188249 +1   -3.2680358 +1   -4.3971616 +1                      0.0000
  O         1.03775275 +1   -1.8113442 +1   -3.8826840 +1                      0.0000
  O        -2.00116792 +1    4.4798882 +1   -8.5967925 +1                      0.0000
 Tv        -0.00741075 +1    0.0191616 +1  -11.1979342 +1 
 Tv         0.16613073 +1    9.5879335 +1    0.0346465 +1 
 Tv        10.37824731 +1   -0.1230428 +1   -0.0248915 +1